Obowiązujące w 2012 r. szczegółowe zasady wystawiania faktur od 1 stycznia 2013 r. uległy zmianie. Katalog danych, które powinna zawierać faktura w 2013 r., zawiera znowelizowany § 5 rozporządzenia Ministra Finansów w sprawie m.in. wystawiania faktur. Stanowi on generalnie odzwierciedlenie danych obowiązujących do końca 2012 r. Jednak został odpowiednio zmodyfikowany. Część danych obligatoryjnie umieszczanych na fakturze pozostała niezmieniona, stanowiąc odzwierciedlenie "starych" przepisów ww. rozporządzenia, np. nazwa (rodzaj) towaru lub usługi, stawki podatku. W założeniu zmiany te miały uprościć zasady dokumentowania transakcji opodatkowanych podatkiem VAT. Jednak podatnicy mają problem z oznaczaniem faktur oraz wątpliwości, czy nadal można używać starych druków faktur.
Od 2013 r. nie ma obowiązku oznaczania faktur określeniem "Faktura VAT". Nic nie stoi jednak na przeszkodzie, aby oznaczenia takie były nadal stosowane.
W zmienionym § 5 rozporządzenia Ministerstwa Finansów w sprawie m.in. wystawiania faktur określono bowiem konieczne elementy faktury, nie zabraniając jednocześnie stosowania elementów dodatkowych. Nie powinno być zatem wątpliwości, że dokument wystawiony w 2013 r. oznaczony tak jak dotychczas jako "Faktura VAT" nie będzie dokumentem wadliwym, a w szczególności nie będzie pozbawiał nabywcy prawa do odliczenia podatku naliczonego.
Powyższe potwierdziło Ministerstwo Finansów w komunikacie opublikowanym na swojej stronie internetowej "Zmiany w zakresie fakturowania VAT". Resort finansów wyjaśnił, że zmiany zawarte w omawianym rozporządzeniu generalnie upraszczają zasady fakturowania. Jednakże, pomimo zniesienia obowiązku podawania niektórych danych w fakturze, podatnicy, którzy np. obecnie oznaczają faktury wyrazami "Faktura VAT", nadal będą mogli to czynić w nowym stanie prawnym. Ministerstwo podkreśliło, iż na fakturach podatnicy mogą również zawierać inne dane, które nie będą już wymagane jako obowiązkowe od 1 stycznia 2013 r. Wyjaśniono także, że zmienione przepisy nie powinny powodować konieczności istotnych zmian w systemach księgowych.